日本政府实行的入境管理制度同大多数国家一样，对不同的入境者发给不同的入境签证。不同的居留资格一般是由不同种类的签证或加注来表示的。日本的签证种类用阿拉伯字母来表示，从4-1-1一直排列到4-1-16。例如，到日本进行旅游观光、探亲访友的，居留资格为4-1-4；留学生的居留资格为4-1-6；到日本进行科研数学活动的，其居留资格为4-1-7等等。其中4-1-16又划分为1、2、3三个类别，居留资格又分为普通居留资格、中级居留资格、高级居留资格和特殊居留资格四种。

日本驻外大使馆或领事馆在签发入境签证时，一般直接在签证下方注明居留资格编号，进入日本国境，入国检查官员在护照相馆上加盖“上陆许可”印章的同时，也同样注明居留资格编号，表示进一步确认入境者的身份。